虎杖悠仁是一位体育万能的高中生，某天他为了从“咒物”危机中解救学姐，而吞下了被诅咒的手指“两面宿傩之指”，成为了咒术之王的“宿傩”寄宿体，被迫加入了专门培养咒术师的学校。在学校里，悠仁成为了“最强咒术师”五条悟的弟子，并与禅院家的继承人伏黑惠、钉崎野蔷薇成为了学校里的一年级新生，而此时突然出现“特级咒物”打乱了所有的学习计划，新的人际关系，满是“咒物”的新世界，最强的咒术师与咒物军团的战斗就此展开。

自幼感情极好的乙骨忧太与祈本里香约好长大后要结婚，却不料里香因死亡车祸化为强大怨灵依附在忧太身边，为此所苦的忧太一心求死，之后在五条悟的带领下进入咒术高专结识了新同学：禅院真希、狗卷棘与熊猫，他决定在这里找到活下去的自信并解除里香的诅咒。意欲夺取里香强大怨灵力量的夏油杰宣布在12月24日举行「百鬼夜行」，在新宿与京都释出上千个诅咒。面临如此重大浩劫，忧太能否阻止夏油的野心并解开里香的诅咒？