格格巫(Gargamel)为了获得强大神奇的蓝精灵汤，制造了一些长相酷似蓝精灵但皮肤是灰色的“淘气精灵”(Naughties)，然而很快他就发现只有真正的蓝精灵才有用，而要想把这些淘气精灵变成真正的蓝精灵，需要一句只有蓝妹妹才知道的秘密咒语。格格巫绑架了蓝妹妹，把她带到了巴黎，因为他要在这里接受“世界上最伟大的魔法师”大奖。为了救回蓝妹妹，蓝爸爸(Papa)、笨笨(Clumsy)、厌厌(Grouchy)、靓靓(Vanity)再度出发来到人类世界，向他们的人类朋友帕特里克和格雷斯求助……

在深林的深处，生活着一群无忧无虑、快乐的小精灵，浑身蓝色，叫做蓝精灵。蓝精灵住在自己村子里蘑菇屋里，精灵爸爸、精灵妹妹、笨笨、乐乐等使得精灵村每天都欢声笑语。可是，在森林深处的城堡里住着一个邪恶的巫师格格巫，他整天策划着怎样找到精灵村，活捉蓝精灵们。蓝精灵们当然不会坐以待毙，蓝精灵运用自己的智慧和格格巫展开了斗争。